随着农业现代化的发展，鱼菜共生系统推广起来，在鱼菜共生系统中，核心三元素鱼、菜、硝化细菌。鱼类可以说在整个系统的运行中首当其冲，系统中植物所需都是从鱼吃食的那一刻开始发生变化。因此选择什么样的鱼，适合鱼菜共生系统的运行就成了我们研究的一个独立方向。下面是惠农网小编整理出最适合鱼菜共生系统的鱼类集锦。
选择鱼的种类时，应注意以下几点：
1.能忍受高密度养殖环境
2.适应本地气候
3.能吃能拉长得快
4.不互相攻击，尤其对小鱼
下面为大家介绍下常用于鱼菜共生的品种：
罗非鱼：俗称:非洲鲫鱼，非鲫、越南鱼、南洋鲫等。原指以莫桑比克为模式产地的口孵非鲫属鱼类物种:莫桑比克口孵非鲫(学名:Oreochromis mossambicus)，现为慈鲷科非鲫属及口孵非鲫属等属数种鱼类的共同俗称;英文里统称为Tilapia。现在它是世界水产业的重点科研培养的淡水养殖鱼类，且被誉为未来动物性蛋白质的主要来源之一。通常生活于淡水中，也能生活于不同盐份含量的咸水中，也可以存活于湖，河，池塘的浅水中。它有很强的适应能力，在面积狭小之水域中亦能繁殖，甚至在水稻田里能够生长，且对溶氧较少之水有极强之适应性。绝大部分罗非鱼是杂食性，常吃水中植物和碎物。
鲫鱼：(学名:Carassius auratus，简称鲫，俗名鲫瓜子、月鲫仔、土鲫、细头、鲋鱼、寒鲋)在欧亚地区为常见淡水鱼，为辐鳍鱼纲鲤形目鲤科鲫属的其中一种鱼类。鲫鱼经过人工养殖和选育，可以产生许多新品种，例如金鱼就是由此产生的一种观赏鱼类，和食用的野生鲫鱼学名同为 Carassius auratus 。
鲶鱼：同鲇鱼。分种较多，常见有鲶鱼(土鲶)大口鲶鱼、胡子鲶(塘鲺)革胡子鲶(埃及胡子鲶)客家俗称滑哥鱼
鲤鱼：鱼类，中文别名:鲤拐子、鲤子。鲤科(Cyprinidae)中粗强的褐色鱼，学名Cyprinus carpio。原产亚洲，后引进欧洲、北美以及其他地区，杂食性。鳞大，上腭两侧各有二须，单独或成小群地生活于平静且水草丛生的泥底的池塘、湖泊、河流中。
鲈鱼：中文里共有四种鱼类都可以被称为鲈鱼，分别是:海鲈鱼，学名日本真鲈，分布于近海，及河口海水淡水交汇处。松江鲈鱼，也称四鳃鲈鱼，属于降海洄游鱼类，最为著名。大口黑鲈，也称加州鲈鱼，从美国引进的新品种。河鲈，也称赤鲈、五道黑，原产新疆北部地区。（注：鱼菜共生系统中以淡水鲈鱼作为选择对象）
虹鳟：(学名:Oncorhynchus mykiss)属鲑形目、鲑科，鱼类。最大体长:120cm，栖息深度:0-5公尺，誉为"水中人参"。善于跳跃，上钩后激烈拼搏。已从北美西部引殖到很多国家。栖于湖泊和急流，体色鲜艳。体上布有小黑斑，体侧有一红色带，如同彩虹，因此得名"虹鳟"。在北京顺义有养殖基地。（注：因虹鳟鱼对水质要求极高，系统建立初期不建议养殖）
金鱼：起源于中国，也称“金鲫鱼”，近似鲤鱼（Cyprinus carpio）但无口须，是由鲫鱼进化而成的观赏鱼类。金鱼的品种很多，颜色有红、橙、紫、蓝、墨、银白、五花等，分为文种、草种、龙种、蛋种四类。在12世纪已开始金鱼家化的遗传研究，经过长时间培育，品种不断优化，现在世界各国的金鱼都是直接或间接由中国引种的。
乌鳢俗称黑鱼，它生性凶猛，繁殖力强，胃口奇大，常能吃掉某个湖泊或池塘里的其他所有鱼类，甚至不放过自己的幼鱼。黑鱼还能在陆地上滑行，迁移到其他水域寻找食物，可以离水生活3天之久。是中国人的"盘中佳肴"。（注：黑鱼生性凶猛，喜肉食，在养殖过程中不建议混养、也不建议与幼鱼同养。）
鳙鱼(学名:Aristichthys nobilis)又叫花鲢、胖头鱼、包头鱼、大头鱼、黑鲢、麻鲢、也叫雄鱼。是淡水鱼的一种。有"水中清道夫"的雅称，是中国四大家鱼之一。外形似鲢鱼，体型侧扁。头部较大而且宽，口也很宽大，且稍微上翘。眼位比较低。鳙鱼生长在淡水湖泊、河流、水库、池塘里。多分布在水域的中上层。是中国特有鱼类。在中国分布范围很广。是池塘养殖及水库渔业的主要对象之一，经济价值较高。能食用，对人体有提高智商、增强记忆、补充营养、延缓衰老的作用。
草鱼属鲤形目鲤科雅罗鱼亚科草鱼属。草鱼的俗称有:鲩、鲩鱼、油鲩、草鲩、白鲩、草鱼、草根(东北)、厚子鱼(鲁南)、海鲩(南方)、混子、黑青鱼等。英文名:Grass carp 。栖息于平原地区的江河湖泊，一般喜居于水的中下层和近岸多水草区域。性活泼，游泳迅速，常成群觅食。为典型的草食性鱼类。草鱼幼鱼期则食幼虫，藻类等，草鱼也吃一些荤食，如蚯蚓，蜻蜓等。在干流或湖泊的深水处越冬。生殖季节亲鱼有溯游习性。已移殖到亚、欧、美、非各洲的许多国家。因其生长迅速，饲料来源广，是中国淡水养殖的四大家鱼之一。
草鱼，鲤科。体延长，亚圆筒形，体长大1m余。体青黄色。头宽平，口端位，无须。咽齿梳状。栖息水的中下层，以水草为食。3-4龄成熟，在江河上游产卵，可人工繁殖。生长快，最大个体达30kg左右。为中国主要淡水鱼类养殖对象。分布于中国各大水系，肉味美，鱼胆有毒。
锦鲤：(Cyprinus carpio haematopterus)在生物学上属于鲤科(Cyprinidae)，鲤科是所有鱼种中最大的一科，超过1400种鱼种。是风靡当今世界的一种高档观赏鱼，有"水中活宝石"、"会游泳的艺术品"的美称。由于它对水质要求不高，食性较杂，易繁殖，所以到人们的赞美、喜爱。